

Où en est-on des connaissances scientifiques sur l’origine du SARS-CoV-2 ? Que nous apprend la phylogénie sur les mutations qui sont survenues depuis son apparition ? Les variants émergents, notamment le variant britannique, sont-ils plus dangereux ?
- Alexandre Hassanin maître de Conférences (HDR) à Sorbonne Université, et chercheur à l’Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité du MNHN
Alors que le Royaume Uni vient de se reconfiner totalement et strictement suite à l’explosion du nombre de contaminations, les pouvoirs publics et les autorités de santé pointent le nouveau variant, identifié en décembre, qui aurait une infectiosité accrue et qui serait à l’origine de cette nouvelle flambée épidémique. Idem en Afrique du Sud, ou un autre cocktail de mutations inquiète les dirigeants du pays et semble accroitre, là encore, la contagiosité. Le tout pendant qu’une mission de l’OMS se rend en Chine à la recherche des origines du virus, sur lesquelles planent encore un doute. Origine, mutations, variants, isolats, on vous dit tout sur les métamorphoses du SARS-CoV2.
Covid : les nouveaux mutants. C’est le programme évolutif qui est le nôtre pour l'heure qui vient. Bienvenue dans La Méthode scientifique.
Et pour tout comprendre sur ces mutations, les risques qu’elles peuvent faire encourir tant en termes de sensibilité à la maladie que vis-à-vis de la vaccination, nous avons le plaisir de recevoir aujourd’hui Etienne Simon-Lorière, virologue, responsable de l’unité Génomique évolutive des virus à ARN à l’Institut Pasteur et Alexandre Hassanin, maître de conférences à Sorbonne Université, membre de l’Institut Systématique, Evolution, Biodiversité au MNHN.
Selon le Premier Ministre britannique, le nouveau variant du SARS-CoV2 qui touche le Royaume Uni serait plus contagieux de 70% par rapport à la version « standard » du virus Même si ce surcroît d’infectiosité n’est pas encore attesté et reste discuté par la communauté virologique, il est indiscutable que ce « nouveau » variant, VUI 202012/01 pour « Variant Under Investigation 2020, mois 12, variant 1 » est devenu majoritaire sur une large partie du territoire. Il ne concernait que 28% des infections en novembre à Londres, taux qui a grimpé à plus de 60% début décembre.
De l’autre côté du globe, l’Afrique du Sud s’inquiète elle aussi pour un autre variant, un cocktail de mutation distinct qui lui aussi, serait responsable d’une plus grande transmissibilité avec les mêmes réserves que pour la Grande Bretagne.
Bref, le petit espoir de sortie de pandémie éveillé par la vaccination vient d’être sévèrement douché par ces multiples variations du virus.
Les bases documentaires
Retrouvez le thread de cette émission sur le fil Twitter de La Méthode scientifique.
- Covid-19 : que sait-on de la variante sud-africaine du virus ? (Sciences et Avenir, 31 décembre 2020)
- CoVid-19 : Le nouveau variant britannique du SARS-CoV2, “un risque élevé” pour l’Europe (Le Monde, 31 décembre 2020)
- CoVid-19 : très contagieux, le variant anglais ne serait pas plus virulent (Sciences et Avenir, 29 décembre 2020)
- Quelles sont les particularités du variant anglais du coronavirus ? (Futurasciences, 28 décembre 2020)
- CoVid-19 : ce que l'on sait sur la nouvelle souche mutée du virus, qui se répand au Royaume-Uni (Sciences et Avenir, 21 décembre 2020)
- Royaume-Uni : un variant du coronavirus SARS-CoV2 porteur de nombreuses mutations (Le Monde, 21 décembre 2020)
- Histoire d'un mutant : comment le coronavirus a évolué (Le Figaro, 18 décembre 2020)
- Les scientifiques intrigués par de nouvelles mutations du SARS-CoV2 (Le Monde, 16 décembre 2020)
- [Dossier] 25/11 > Aspects immunologiques et virologiques de l’infection par le SARS-CoV2 (HAS Santé)
- Compte rendu de l'Académie des Sciences : Origine, évolution et propagation mondiale du SARS-CoV2 (24 novembre 2020)
- “La question de l'origine du SARSCoV-2 se pose sérieusement” (CNRS Le Journal, 28 octobre 2020)
- Le coronavirus est-il devenu moins dangereux cet été suite à une mutation ? (Le Figaro, 23 septembre 2020)
- Que sait-on des mutations du SARS-CoV2 et de leurs effets ? (The Conversation, 13 septembre 2020)
- Retrouver les origines du SARS-CoV2 dans les phylogénies de coronavirus
- Coronavirus SARS-CoV2 : quelle importance revêt la mutation génétique D614G ? https://bit.ly/38lY6D2 via (Le Monde, 6 juillet 2020)
- Origine et évolution du SARS-CoV2 (Académie des Sciences, 11 juin 2020)
- [A découvrir] La plateforme GISAID, qui recense les variants du SARS-CoV2 de par le monde depuis le début
- [A découvrir] La plateforme Nextstrain qui recense les variants du SARS-CoV2 de par le monde depuis le début
- [Phylogénie] L’arbre phylogénétique des betacoronavirus SARS-like, incluant le SARS-CoV2
- [Phylogénie] L’arbre phylogénétique du SARS-CoV2 (GISAID)
- [Infographie] Des vaccins via instructions génétiques (AFP)
Les références musicales
Le titre du jour : "Erreur 404" par L’Impératrice
Le générique de début : "Music to watch space girls by" par Leonard Nimoy
Le générique de fin : "Says" par Nils Frahm
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